More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1083 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  100 
 
 		 145 aa  289  9e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  94.48 
 
 		 145 aa  275  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  88.89 
 
 		 108 aa  196  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  42 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  41.26 
 
 		 390 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  39.72 
 
 		 306 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 324 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 291 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 449 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.84 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.25 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  40.14 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.78 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.05 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.06 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.03 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.57 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  34.53 
 
 		 291 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.9 
 
 		 304 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  31.62 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.3 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.87 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.67 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  34 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  37.67 
 
 		 415 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.25 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.41 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.17 
 
 		 307 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.48 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.33 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  34.69 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  36.81 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.21 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.24 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.81 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.87 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.72 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.56 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.81 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.25 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.23 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 297 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.11 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.61 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.72 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  31.16 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  35.29 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.95 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  36.49 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.77 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.56 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.89 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.65 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.17 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.97 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  36.55 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>