More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4308 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  72.11 
 
 		 147 aa  224  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  69.39 
 
 		 147 aa  214  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  69.39 
 
 		 147 aa  209  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  64.63 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  64.63 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  64.38 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  63.95 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  54.05 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  38.78 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  40.54 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  40.54 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  38.78 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  41.22 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  39.86 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  41.5 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  38.1 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  37.41 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 171 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  38.78 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  39.33 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  39.46 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  36.73 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.05 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  36.49 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  37.41 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  37.27 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  37.27 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.77 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  35.33 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  39.47 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  33.56 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.54 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  33.56 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.49 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.16 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.82 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.64 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.21 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.41 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  31.9 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  31.82 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  31.82 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  31.9 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.11 
 
 		 291 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  32.17 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.41 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.6 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.41 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.18 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  38.93 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  30.26 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.42 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  35.53 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.25 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  36.73 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  36.05 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  36.73 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>