More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1055 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  44 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 149 aa  106  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  40.13 
 
 		 145 aa  103  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  47.37 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  46.1 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  40.67 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  40.67 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  41.72 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.05 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.49 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  37.16 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  36.49 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  36.49 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  36.49 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  35.81 
 
 		 168 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.81 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.81 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  35.81 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  33.78 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  34.46 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  33.78 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  37.91 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  37.84 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.78 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  34.46 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  35.81 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.42 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  31.9 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  34.67 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  35.85 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  33.56 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  33.56 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  34.94 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  33.54 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  30.61 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.67 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.64 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.64 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.41 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  32.67 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  31.58 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  33.11 
 
 		 166 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  37.89 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.53 
 
 		 291 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.57 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.13 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.1 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.82 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 274 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.72 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.8 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  28.95 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.76 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.06 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  32.24 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>