More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4660 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  100 
 
 		 144 aa  286  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  44.74 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  47.68 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  41.33 
 
 		 144 aa  121  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  41.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  42.76 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  46.21 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  40.67 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  46.67 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  44.37 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  44.08 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  41.72 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  40.28 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  42.95 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  41.72 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  41.72 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  39.33 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  41.33 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  38.67 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  36.55 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  40.94 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  40.94 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  36.3 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  36.3 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  40.13 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40.13 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  37.91 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  38.26 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  35.53 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  34.25 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  34.42 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  34.42 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  32.68 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.25 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.37 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  32.43 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.04 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.25 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.92 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.03 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  34.44 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.72 
 
 		 208 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.88 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  38.19 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.26 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.97 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  37.25 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.56 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 274 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  31.13 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  34.97 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.62 
 
 		 288 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.01 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.33 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.41 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.1 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.04 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>