More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3875 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  54.73 
 
 
145 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  60 
 
 
149 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  51.33 
 
 
149 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  49.32 
 
 
148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  48.67 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  48.67 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  51.02 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  47.37 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  47.37 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  45.58 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 
149 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  42.95 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  44.52 
 
 
151 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  39.46 
 
 
147 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  40.54 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  42.18 
 
 
147 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  41.89 
 
 
168 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  41.89 
 
 
144 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  41.89 
 
 
144 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
147 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  41.78 
 
 
156 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  37.5 
 
 
144 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  39.04 
 
 
144 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  39.04 
 
 
144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
144 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  39.86 
 
 
144 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  39.46 
 
 
144 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  38.36 
 
 
144 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  37.41 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  37.41 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  40.27 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.73 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  36.73 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  42.57 
 
 
143 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  37.67 
 
 
145 aa  93.2  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
144 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  39.04 
 
 
144 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
144 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  38.26 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  38.26 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  38 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  36.73 
 
 
146 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.05 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  39.19 
 
 
287 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.66 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
146 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  35.37 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.81 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  38.93 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.99 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.53 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  42 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  39.73 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.25 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.62 
 
 
207 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
449 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.55 
 
 
173 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  36.05 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.62 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.33 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.94 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.93 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.24 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.42 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.19 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.9 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  33.78 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.99 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.13 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  38.51 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  35.17 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>