More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1676 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  68.06 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  52.08 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  50 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  50 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  49.31 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  48.61 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  50 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  50.69 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  47.92 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  49.31 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  49.31 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  50.69 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  50 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  50.69 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  50.69 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  50.69 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  44.22 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  42.47 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  42.47 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  39.73 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  40 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  41.22 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  39.86 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.25 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  36.73 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.33 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  38 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  36.81 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  37.93 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  35.81 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.72 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  35.81 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  36.55 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.79 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.16 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  35.33 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  39.31 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.36 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.55 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.62 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.24 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  30.56 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.51 
 
 		 304 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  29.86 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.86 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.69 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  37.67 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>