More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3490 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  37.24 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  39.04 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.33 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  34.48 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.33 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  38.26 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  35.33 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  40 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  37.67 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  33.79 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  32.21 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  36 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  33.75 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  32.19 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  35.14 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  33.12 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  31.79 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  31.79 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  30.14 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  31.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  37.41 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  31.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  34.48 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  31.29 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  31.13 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  31.76 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  34 
 
 		 306 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  36.05 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  36.99 
 
 		 325 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.22 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.61 
 
 		 290 aa  63.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.46 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  26.17 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  26.17 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.64 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  30.46 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  29.73 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  27.52 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.33 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.68 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  30.97 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.05 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.94 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 297 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.72 
 
 		 280 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.58 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.61 
 
 		 304 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>