More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3943 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  100 
 
 		 148 aa  298  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  51.01 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  51.01 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  49.32 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  43.42 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  44 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  44 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  43.05 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  49.01 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  37.16 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  40.94 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  38.82 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  37.16 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  41.89 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  35.81 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.49 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  35.33 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.84 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.33 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  31.76 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  36.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  36.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  36.24 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  35.57 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.06 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  35.57 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  31.08 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  35.57 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  35.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  35.1 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  33.78 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  34.48 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  32.43 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  32.43 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.21 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.61 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.36 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  34.42 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  34.42 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.09 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.42 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  31.54 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  32.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  32.21 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  34.44 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.19 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  31.54 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.82 
 
 		 276 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  37.09 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.47 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.72 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  34.87 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  32.24 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.14 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.54 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.29 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  30.87 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.92 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  28.95 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  28.95 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>