More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3202 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  100 
 
 		 151 aa  309  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.97 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  31.54 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.09 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  35.62 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.43 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.72 
 
 		 320 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.1 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.11 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  36.91 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.93 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.12 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  34.48 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.38 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  31.61 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.25 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.24 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  29.3 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.25 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.69 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.29 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.65 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.2 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32.69 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.49 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  31.82 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  30.56 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.51 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.51 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.76 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  36.6 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  32.67 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.03 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.17 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.41 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  28.08 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  29.05 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  29.33 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.21 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  29.87 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  30.97 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.52 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  29.17 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  28.19 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  27.21 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  30.2 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  29.17 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  30.32 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.58 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.14 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  30.32 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  30.32 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.58 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 274 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.96 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  30.32 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.45 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.9 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  30.32 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.52 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  33.56 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  33.56 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.87 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  30.26 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.21 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.95 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.67 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.54 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.14 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>