More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1233 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  96.53 
 
 		 168 aa  284  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  78.47 
 
 		 144 aa  248  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  78.47 
 
 		 144 aa  245  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  65.97 
 
 		 144 aa  205  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  65.28 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  63.89 
 
 		 144 aa  202  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  63.89 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  63.89 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  63.19 
 
 		 144 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  63.19 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  65.97 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  65.97 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  65.97 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  56.25 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  55.48 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  55.48 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  54.42 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  51.7 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  51.37 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  48.61 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  47.59 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  40.69 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  42.57 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  41.72 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  44.3 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  42.57 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  41.22 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  40.14 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  35.81 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  35.81 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  41.38 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  36.99 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  37.5 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  37.5 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  39.6 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  36.24 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  38.17 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  34.93 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  35.33 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  35.86 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.69 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.72 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  31.03 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  31.03 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  33.56 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.03 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  31.03 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  31.03 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.79 
 
 		 180 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.25 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  31.03 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.17 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.41 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.37 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>