More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0463 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  86.99 
 
 		 146 aa  236  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  36.99 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  36.99 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  39.31 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  36.73 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  38.26 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  38.67 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.86 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  39.73 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.86 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  36.55 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  43.14 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  40.67 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  38.51 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.51 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  37.24 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  35.14 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  35.14 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.14 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  36.05 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  37.41 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38.26 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  35.37 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  35.81 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.11 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  34.25 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  38.16 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  35.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  35.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  41.94 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.75 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  40.54 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  34.69 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  34.93 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.69 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  34.9 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  31.54 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.1 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  37.58 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.62 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  37.06 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  32.41 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  35.33 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  33.79 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.55 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.17 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.97 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.56 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.88 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.46 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  30.67 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  30.67 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  34.03 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>