More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2059 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  100 
 
 		 156 aa  320  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  51.03 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  51.05 
 
 		 145 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  47.62 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  45.95 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  43.45 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  46.67 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  43.45 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  43.45 
 
 		 144 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  40.69 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  40.69 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  40.69 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  40.69 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  45.21 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  46.21 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40.82 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  42.18 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  43.45 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  41.89 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  44.83 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  37.67 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  37.67 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  41.22 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  42.76 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  36.49 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  36.49 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  35.76 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  35.76 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.05 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.84 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  41.78 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  39.46 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.91 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.49 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.41 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.75 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  36.73 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  35.66 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  34.48 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  38.1 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.97 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.45 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.93 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.41 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  36.49 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.05 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.5 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  40.94 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.03 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  33.78 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.46 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.38 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  32.3 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.66 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>