More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2637 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  69.44 
 
 
144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  47.92 
 
 
144 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  49.31 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  49.31 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  46.53 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  48.61 
 
 
149 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  47.22 
 
 
144 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  46.53 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  48.61 
 
 
144 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  48.61 
 
 
144 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  46.53 
 
 
144 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  46.53 
 
 
144 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
144 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  46.53 
 
 
144 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  44.44 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  44.44 
 
 
144 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  46.26 
 
 
147 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  47.22 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  47.22 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  47.22 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  48.97 
 
 
151 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  46.21 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  42.67 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  39.58 
 
 
144 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  44.59 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  42.07 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  42.18 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  40.28 
 
 
145 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
148 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  40.28 
 
 
145 aa  103  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  42.86 
 
 
147 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  40.27 
 
 
149 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  40.27 
 
 
149 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  45.58 
 
 
146 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
149 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  39.33 
 
 
148 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  39.58 
 
 
145 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.11 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  40.28 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  38.78 
 
 
148 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  38.19 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  35.62 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  35.62 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  42.95 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  35.14 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.78 
 
 
180 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  35.14 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  39.31 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.72 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.97 
 
 
288 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  33.33 
 
 
207 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.24 
 
 
155 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  34.35 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.46 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.25 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.1 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  34.29 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  34.01 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.8 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.03 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.69 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.57 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  36.24 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.62 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32.65 
 
 
200 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>