More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1774 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  42 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  44.22 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 172 aa  88.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  33.96 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  33.1 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.21 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  35.57 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  35.14 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.91 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.62 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.01 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  32.88 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.94 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.88 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  34.23 
 
 		 303 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1035  UspA domain protein  29.73 
 
 		 293 aa  70.5  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  30 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  34.29 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  28.67 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.01 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  29.17 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.71 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  30.99 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.94 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.27 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.28 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  31.51 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  30.82 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.97 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  29.29 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.43 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  35.46 
 
 		 390 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  32.92 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  31.69 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.89 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.1 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  30.94 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  31.51 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  33.56 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.1 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.57 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.97 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.97 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  35.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.56 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.5 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.54 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.39 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.17 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.32 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.09 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.67 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.66 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.41 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.57 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  35.97 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.99 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.56 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.87 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  34.78 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>