More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4323 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  86.99 
 
 		 146 aa  271  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  57.53 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  56.85 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  56.16 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  55.48 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  55.48 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  50.68 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  49.32 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  48.63 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  50.68 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  45.21 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  42.47 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  40.54 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  37.84 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  36.3 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  37.67 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  38.36 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.46 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.43 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  33.56 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  34.87 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  31.72 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  33.11 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  33.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  33.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  31.54 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.57 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  30 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.9 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  30 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  34.93 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.51 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  37.75 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  30.77 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  36.91 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  31.08 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  33.55 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  38 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.55 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.79 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  34.69 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.03 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.03 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  39.58 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  32.41 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  34.03 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.34 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.88 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.72 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.03 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.65 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.38 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.07 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.56 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>