More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0997 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  81.63 
 
 		 147 aa  244  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  76.71 
 
 		 148 aa  223  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  67.35 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  65.99 
 
 		 147 aa  206  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  63.95 
 
 		 147 aa  199  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  64.63 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  66.67 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  52.7 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  42.18 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  41.89 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  41.22 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  43.92 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  41.89 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  42.48 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  42.48 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  41.22 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  41.22 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  41.22 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  41.89 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  40.27 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  39.19 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  39.19 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  40.13 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  39.46 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  38.1 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  33.78 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.99 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.49 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  37.16 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  43.51 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  32.43 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  32.43 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.6 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  33.57 
 
 		 181 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.89 
 
 		 187 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  37.91 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  37.91 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  36.73 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  40.94 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.9 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.56 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.6 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  42.18 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  40.79 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.89 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.11 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  38.26 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.56 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.44 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  33.76 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.74 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.76 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  38.73 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.16 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.41 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.69 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.78 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.91 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.08 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  36.3 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>