More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2586 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  66.9 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  54.61 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  49.26 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  52.55 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  51.45 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  45.07 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  49.65 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  48.92 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  44.85 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  44.85 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  44.85 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  45.32 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  44.12 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  40.43 
 
 		 165 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  41.54 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  40.44 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  45 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.71 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.03 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.76 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.48 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  37.96 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  40.85 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.11 
 
 		 290 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  33.53 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  38.41 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.66 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.25 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.97 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.17 
 
 		 300 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  38.73 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.58 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  33.8 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  33.82 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  36.62 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.41 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.82 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.75 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.29 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.06 
 
 		 287 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.45 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  34.81 
 
 		 301 aa  73.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.29 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  34.04 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  31.76 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.65 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.5 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  34.04 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.27 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  35.21 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.72 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.29 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.62 
 
 		 297 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  30.82 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.62 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.72 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.91 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.43 
 
 		 307 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.21 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  32.1 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.78 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>