More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0624 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  100 
 
 
139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  59.26 
 
 
137 aa  166  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  47.45 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  37.93 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.67 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  37.32 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.67 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
145 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.36 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  34.31 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.62 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.72 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.86 
 
 
307 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  35.81 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.92 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  37.41 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  36.73 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  35.81 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.67 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.21 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  35.14 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.14 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.14 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.97 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.69 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  37.93 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.69 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.79 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.42 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  34.03 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  36.17 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  33.33 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35.66 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.92 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  33.33 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.64 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.64 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  32.64 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.56 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.79 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  36.17 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  40.96 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.64 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.47 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.11 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  34.65 
 
 
301 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  35.51 
 
 
283 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.17 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.67 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.94 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.16 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  31.76 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.69 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  31.76 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.62 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.47 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>