More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1945 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  100 
 
 
139 aa  285  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  36.43 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
141 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  35.37 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.03 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  32.41 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.21 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.57 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.51 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30.28 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30.28 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30.28 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30.28 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30.28 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.37 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.48 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.77 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30.28 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  29.37 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.1 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  36.11 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  26.9 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.61 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.88 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30.28 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.56 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.56 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  25.9 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.03 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  29.86 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.37 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  34.03 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.93 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  30.99 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.19 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  32.64 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.91 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  30.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  32 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  32.88 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  30.56 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.97 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.56 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  29.37 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.46 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.86 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.41 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.86 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.62 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.57 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  31.65 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.56 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.11 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  33.56 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.97 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.87 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
291 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  29.71 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  30.56 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  32.37 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.29 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.45 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.48 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  32.65 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.08 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.19 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.87 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.47 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
250 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  30.67 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  30.14 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.76 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  29.53 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.61 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.58 
 
 
305 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>