More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3922 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  37.32 
 
 		 156 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  41.55 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  34.51 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  36.99 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  40.14 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.17 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  31.94 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  34.72 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  36.43 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  37.67 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  32.86 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  33.1 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  30.28 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.99 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  32.39 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.1 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.37 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  32.89 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.07 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  34.72 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.78 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  31.94 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  29.66 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 449 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.64 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.87 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.8 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.99 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.77 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.97 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  36.63 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.33 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.47 
 
 		 280 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.37 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  32.88 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.5 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  33.79 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.79 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.37 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  30.94 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.28 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.17 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.5 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  30.82 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  29.29 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.14 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  30.28 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  31.29 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  31.29 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.37 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.1 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.99 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.94 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.93 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.27 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>