More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1924 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  278  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  52.11 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  41.96 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  35.17 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  36.24 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.88 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.8 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  34.25 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  34.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 316 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  35.81 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  33.79 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  39.86 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  34.25 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  35.86 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  33.79 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.91 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  36.11 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  31.21 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  29.45 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.79 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.82 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  35.14 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.25 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.62 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.56 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.69 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  33.79 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.47 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  30.99 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.88 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  34.72 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 313 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  30.46 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.86 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  29.73 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  30.5 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  27.97 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  33.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.25 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  32.64 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  32.24 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  32.24 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.08 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  36.62 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.83 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 449 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  33.11 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.78 
 
 		 290 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  30.46 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.87 
 
 		 305 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  30.77 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  31.08 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.97 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.97 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.86 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.22 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.34 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.61 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  33.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  33.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  33.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  33.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  33.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  33.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>