More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1454 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  73.79 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  72.41 
 
 		 146 aa  217  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  73.1 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  69.86 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  58.9 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  41.1 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  42.76 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  42.76 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  40.41 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  41.38 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  39.31 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.04 
 
 		 320 aa  87.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.69 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 145 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.37 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.3 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.77 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.77 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.44 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.1 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.62 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.34 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.65 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.36 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.97 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.67 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.43 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.79 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35.66 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  36.81 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.72 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.72 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.21 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.56 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.43 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  30.82 
 
 		 296 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.29 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.12 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.11 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.51 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.42 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.11 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.46 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.11 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.21 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  34.27 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.79 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  30.72 
 
 		 212 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.05 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  45.59 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.86 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.56 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.37 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  33.79 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.57 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.25 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.72 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  50 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.39 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  35.76 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.7 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  46.38 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 325 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.08 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  52.54 
 
 		 290 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  28.86 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.47 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  50 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.12 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.17 
 
 		 300 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.57 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>