More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1666 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  54.11 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  53.57 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  41.45 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  34.29 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  36.43 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  32.14 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  32.62 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.81 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.43 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.04 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.22 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  31.65 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  31.65 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  31.65 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  34.25 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.56 
 
 		 286 aa  67.4  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.32 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.94 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  25.5 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  27.78 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  37.93 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.73 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.62 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  31.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  37.84 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.22 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.43 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  32.88 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  33.55 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  30.07 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  30.22 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  32.62 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.03 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.66 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.17 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  26.95 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  31.91 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.67 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.97 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.14 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.08 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.54 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  37.93 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  29.93 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  32.41 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.62 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.45 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.56 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.82 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.25 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.24 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.07 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  25 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>