More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2474 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  41.84 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  32.62 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  31.91 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  30.5 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  34.72 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  29.29 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.86 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  31.91 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  34.04 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  29.29 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  32.14 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  31.69 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  31.69 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  30.61 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  32.21 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.22 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  34.51 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.43 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.88 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.99 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.51 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  37.93 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  30.99 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.5 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.28 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  29.86 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  45.59 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.66 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.56 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  26.95 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  26.43 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  29.05 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.17 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  31.21 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  31.29 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  31.21 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  30.94 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.77 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  34.09 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.94 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  29.55 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  28.87 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.5 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  31.94 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  30.94 
 
 		 306 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  28.47 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.43 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  49.06 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.06 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  32.37 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.72 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  49.06 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.85 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  30.5 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  30 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>