More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0276 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  100 
 
 
138 aa  270  6e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  61.43 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  49.64 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  46.76 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  45.07 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  43.36 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  42.47 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  43.26 
 
 
145 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  42.03 
 
 
144 aa  105  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  43.17 
 
 
147 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  40.85 
 
 
145 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  42.55 
 
 
144 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  42.45 
 
 
138 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.29 
 
 
141 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  43.57 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  38.13 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  37.86 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  42.14 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  40.58 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  34.31 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  37.41 
 
 
143 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  36.67 
 
 
295 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.03 
 
 
180 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  31.91 
 
 
142 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  39.29 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.73 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.88 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.41 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.36 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.89 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  34.78 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.92 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  34.06 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.87 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  37.68 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  38.06 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.39 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  40.29 
 
 
283 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  35.33 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  38.13 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.67 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.12 
 
 
286 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.53 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.53 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  32.64 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  36.09 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
449 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  42.17 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.8 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.97 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.51 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.91 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.1 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  49.21 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.92 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.81 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.58 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  28.37 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  39.33 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  29.14 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.09 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  35.71 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.5 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.88 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.31 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.88 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  47.5 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.97 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.72 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.14 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.09 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.58 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.99 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.41 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.23 
 
 
280 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.06 
 
 
288 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>