More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1243 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  59.71 
 
 
139 aa  174  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  61.87 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  60.99 
 
 
141 aa  166  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  53.19 
 
 
142 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  43.57 
 
 
140 aa  104  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  43.8 
 
 
138 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  38.3 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  40.88 
 
 
138 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  42.55 
 
 
142 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  42.07 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  43.06 
 
 
145 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  37.76 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  41.3 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  40.71 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  36.11 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  35.77 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  34.46 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.8 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  37.76 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40.29 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  36.62 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  34.75 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.17 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.36 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  34.29 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  37.42 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  34.31 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  33.78 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  33.33 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  36.49 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  35.71 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.72 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.23 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.43 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.67 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.17 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.07 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  28.78 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  28.78 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  37.59 
 
 
295 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.48 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.56 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.43 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.99 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.34 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.97 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
274 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  28.77 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.79 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.86 
 
 
287 aa  58.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.89 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.8 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.86 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  36.05 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.55 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.24 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.25 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  30.82 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.25 
 
 
288 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  31.08 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.37 
 
 
286 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
449 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.58 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  28.67 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  23.02 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  28.57 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.06 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.14 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.66 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  28.77 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.66 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  23.13 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  24.29 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  31.03 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  31.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.14 
 
 
170 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.14 
 
 
170 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>