More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2779 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  285  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  46.94 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  40.43 
 
 
142 aa  122  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  45.45 
 
 
144 aa  120  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  42.14 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  41.96 
 
 
144 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  43.26 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  42.48 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  38.46 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  39.6 
 
 
295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  44.93 
 
 
138 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  39.72 
 
 
142 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  43.48 
 
 
138 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  40.97 
 
 
145 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  42.14 
 
 
176 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.97 
 
 
141 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  42.86 
 
 
140 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  38.13 
 
 
138 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  42.36 
 
 
144 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  41.96 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  35.25 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  38.57 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  36.99 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  43.45 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.84 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  38.41 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.42 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.72 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  36.88 
 
 
137 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  36.88 
 
 
295 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  35.46 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  38.67 
 
 
151 aa  84  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  38.03 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.03 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  36.11 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  34.75 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  33.77 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.46 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.66 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.67 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.33 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.21 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.46 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.69 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.19 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.56 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.51 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  32.14 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  32.14 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.51 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.03 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.88 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.78 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.48 
 
 
208 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.31 
 
 
305 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.52 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.43 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.33 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.17 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.05 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.41 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3734  UspA domain protein  33.57 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.47 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.72 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.62 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  33.33 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  42.05 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.04 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  31.94 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.87 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.56 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  30.26 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  54.39 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  54.39 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1626  UspA domain protein  31.65 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  39.08 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  33.12 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.82 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.56 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.66 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  35.46 
 
 
283 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.5 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  30 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.79 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>