More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3643 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  52.14 
 
 
145 aa  142  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  48.94 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  46.43 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  44.9 
 
 
142 aa  117  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  41.55 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  44.9 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  47.33 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  43.36 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  45.45 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  42.38 
 
 
144 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  43.24 
 
 
149 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  42.18 
 
 
145 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  44.2 
 
 
138 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  46.31 
 
 
150 aa  103  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  42.14 
 
 
140 aa  103  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  46.45 
 
 
150 aa  103  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  43.67 
 
 
140 aa  103  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  44.06 
 
 
139 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  38.3 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  45.65 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  38.67 
 
 
295 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  40.29 
 
 
138 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  41.43 
 
 
295 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  45.64 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  40.43 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  40.97 
 
 
142 aa  95.9  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  42.07 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  44.06 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  43.75 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.27 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  45.64 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.67 
 
 
180 aa  87  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  36.62 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  40.28 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  40.28 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  37.14 
 
 
176 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  37.34 
 
 
159 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.41 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  39.33 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  40.28 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  38.51 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  39.58 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.81 
 
 
294 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36.84 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  38.41 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.09 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  38.89 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.44 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.46 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.16 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.8 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  38 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.16 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.62 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  33.57 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  38.03 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  38.89 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  38.89 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.27 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.25 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.25 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.97 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.87 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.33 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.67 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.99 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.55 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.12 
 
 
305 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.67 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
449 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.42 
 
 
207 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.81 
 
 
287 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  35.92 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.78 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.66 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.48 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  37.84 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.17 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.05 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.57 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  34.44 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.69 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.11 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>