More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3822 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  100 
 
 
159 aa  322  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  40.62 
 
 
147 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  38.71 
 
 
142 aa  104  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  37.66 
 
 
145 aa  104  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  37.66 
 
 
142 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  38.06 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  37.34 
 
 
141 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  34.39 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  33.76 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  38.46 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  33.13 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  31.48 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  33.12 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  37.75 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  37.42 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.94 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  35.06 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.54 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  35.76 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  32.68 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  36.54 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  37.42 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  36.13 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  29.11 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.77 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.14 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.52 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  36.54 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  35.95 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  34 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  34.21 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  36.13 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.48 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.05 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.85 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25.66 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
306 aa  61.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  29.87 
 
 
295 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  30.26 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.17 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.05 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  27.1 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 
138 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  31.33 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.37 
 
 
141 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  32.9 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.92 
 
 
325 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.21 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.19 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  28.75 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.66 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.76 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.57 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  31.41 
 
 
321 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  29.41 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  27.85 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.52 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
218 aa  54.3  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  27.5 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  32.26 
 
 
142 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  31.52 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.05 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1965  UspA domain protein  30.06 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  26.75 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.13 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.32 
 
 
304 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0609  UspA domain protein  29.14 
 
 
273 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.33 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.67 
 
 
288 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  30.13 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.22 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 
449 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.26 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.62 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  28.66 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.27 
 
 
150 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.41 
 
 
144 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
139 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.21 
 
 
154 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  31.71 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  41.33 
 
 
153 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 
157 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>