More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0904 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  293  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  56.21 
 
 
143 aa  143  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  46.94 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  43.42 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  39.49 
 
 
149 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.84 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  38.67 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  33.99 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  42.86 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  38.51 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  40.79 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  39.74 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  40.14 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  38.06 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40.67 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  38.61 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  38.31 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  39.22 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  38.26 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  37.58 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  35.14 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3734  UspA domain protein  39.07 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1965  UspA domain protein  36.13 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  35.29 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
297 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  37.75 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  39.74 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.67 
 
 
288 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  36.42 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.49 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.67 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.69 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  34.9 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35.71 
 
 
305 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.64 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.93 
 
 
286 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  36.42 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.45 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  32.92 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.37 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  35.14 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30.26 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.77 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.64 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  37.5 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  36.42 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.72 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  34.9 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.57 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.67 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  31.85 
 
 
295 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
297 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.99 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.89 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.78 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.67 
 
 
297 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  32.9 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  32.67 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  31.85 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  31.85 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.78 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  48.44 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.26 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.05 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
449 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
218 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  35.1 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  41.86 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.11 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.89 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  32.45 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.76 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.76 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.82 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  33.33 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  28.3 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.97 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.03 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  45.16 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.73 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34.19 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.67 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.57 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  32.89 
 
 
294 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
291 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.12 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>