More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1467 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  100 
 
 
180 aa  353  6.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  56.44 
 
 
158 aa  176  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  60.14 
 
 
159 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  58.45 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  48.94 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  46.9 
 
 
150 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  45 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  51.75 
 
 
148 aa  137  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 
145 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  48.98 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 
145 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  44.68 
 
 
150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  47.71 
 
 
156 aa  123  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
145 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  49.65 
 
 
144 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  44.12 
 
 
141 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.16 
 
 
148 aa  114  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  43.26 
 
 
149 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  45.45 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  48.23 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  44.06 
 
 
148 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 
147 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  42.18 
 
 
157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  44.52 
 
 
145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  40.28 
 
 
151 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  44.68 
 
 
288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.97 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  43.98 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  43.84 
 
 
286 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  47.14 
 
 
287 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  46.94 
 
 
156 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.96 
 
 
208 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  46.81 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  44.44 
 
 
307 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  44.59 
 
 
153 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  42.86 
 
 
152 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
143 aa  104  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  47.68 
 
 
151 aa  104  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  42.5 
 
 
120 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  41.67 
 
 
151 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  43.66 
 
 
147 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  41.13 
 
 
207 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  42.96 
 
 
290 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.24 
 
 
297 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.62 
 
 
144 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  43.75 
 
 
143 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  42.38 
 
 
305 aa  98.2  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  41.67 
 
 
149 aa  97.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  42.76 
 
 
144 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.62 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  40.54 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  40.4 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.17 
 
 
142 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  40.54 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  45.45 
 
 
141 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  42.95 
 
 
281 aa  95.9  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
153 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  40.56 
 
 
142 aa  95.5  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  43.97 
 
 
280 aa  95.5  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  41.33 
 
 
157 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  39.58 
 
 
150 aa  95.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  41.43 
 
 
283 aa  94.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  40.67 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.6 
 
 
130 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  43.45 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  45.52 
 
 
301 aa  92.8  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  39.19 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
142 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40.82 
 
 
147 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 
159 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  91.3  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  40.29 
 
 
301 aa  91.3  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  39.86 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  45.07 
 
 
141 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.94 
 
 
300 aa  90.5  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 
297 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  38.57 
 
 
145 aa  88.6  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
144 aa  88.2  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
143 aa  87.8  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
153 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  42.45 
 
 
137 aa  87.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  42.17 
 
 
167 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  40 
 
 
200 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.97 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  39.57 
 
 
145 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  41.83 
 
 
151 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
128 aa  87  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  38.03 
 
 
138 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
162 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.67 
 
 
141 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  40.52 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
297 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  40.52 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  40.52 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>