More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1294 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  100 
 
 
152 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  76.82 
 
 
153 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  74.17 
 
 
152 aa  234  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  74.67 
 
 
153 aa  231  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  72.48 
 
 
150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  60.93 
 
 
152 aa  205  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  68.31 
 
 
153 aa  203  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  44.74 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
145 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  42.95 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  39.19 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  36.55 
 
 
155 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  38.62 
 
 
154 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  37.58 
 
 
212 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  36.36 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  38.93 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  40 
 
 
162 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  39.86 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  38.46 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  37.33 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
162 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  37.76 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  33.78 
 
 
151 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
172 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  37.24 
 
 
146 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
143 aa  87  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
143 aa  87  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.91 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  37.41 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  37.41 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.8 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.17 
 
 
287 aa  85.5  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  37.41 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  37.84 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  36.54 
 
 
149 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.53 
 
 
154 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  34.03 
 
 
143 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  37.59 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  37.59 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.06 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  36.88 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  35.46 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.17 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.17 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  35.71 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.01 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  35.17 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  35.71 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.86 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.55 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  36.81 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.21 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  29.8 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  37.24 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.53 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.25 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.33 
 
 
320 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  35.86 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.21 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  31.69 
 
 
296 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  34.87 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.03 
 
 
290 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  35.14 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  35.14 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  33.33 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  32.41 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.18 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  36.67 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  35.14 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  33.82 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>