More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2521 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.91 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.87 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.97 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.91 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.67 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.8 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.99 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  30.82 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  30.82 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.94 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.34 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.08 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.41 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  34.69 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.03 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.57 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  32.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  32.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.21 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  44 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.04 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.91 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.65 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.94 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  32.21 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.17 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32.21 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.26 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  32.21 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.17 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.9 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  60 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.19 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  59.18 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.07 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  30.5 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  28.77 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.37 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  31.43 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  26.76 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  40.24 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.82 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.56 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  27.92 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.97 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  32.17 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  34.44 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  50 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.58 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  32.19 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  33.33 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.11 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.5 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.86 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.08 
 
 		 276 aa  57.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>