More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1022 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  286  9e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  97.24 
 
 
145 aa  276  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  95.86 
 
 
145 aa  273  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  82.76 
 
 
145 aa  245  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  66.21 
 
 
148 aa  202  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  46.81 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  43.97 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.55 
 
 
180 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  45.39 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  42.86 
 
 
157 aa  123  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  44.85 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.13 
 
 
158 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  46.1 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.43 
 
 
159 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38.57 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  43.36 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  40.14 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.25 
 
 
151 aa  110  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  40.41 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.13 
 
 
144 aa  103  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 
147 aa  102  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.5 
 
 
156 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.58 
 
 
148 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  41.96 
 
 
148 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.32 
 
 
142 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
143 aa  100  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  39.04 
 
 
152 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  43.71 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.87 
 
 
307 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  37.5 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.62 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  39.06 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.6 
 
 
200 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.14 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.33 
 
 
156 aa  94  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.42 
 
 
290 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  38.93 
 
 
305 aa  93.6  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.16 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.16 
 
 
153 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.67 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  37.58 
 
 
200 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
148 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  37.58 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  37.58 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  37.58 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  37.58 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  37.58 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.11 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.43 
 
 
300 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  34.72 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.14 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.81 
 
 
153 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.49 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  36.11 
 
 
145 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.88 
 
 
145 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  38.13 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.99 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  37.93 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35 
 
 
153 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.94 
 
 
208 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.21 
 
 
280 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.18 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  37.59 
 
 
294 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.94 
 
 
207 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.62 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  33.79 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.25 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  84  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
145 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.46 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  34 
 
 
184 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.62 
 
 
320 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  37.5 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.21 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.14 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.64 
 
 
286 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  35.66 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  36.55 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.62 
 
 
297 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  35.66 
 
 
415 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.72 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.87 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.57 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  32.87 
 
 
283 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>