More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0101 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  276  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  63.12 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  62.41 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  60.99 
 
 		 139 aa  166  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  52.45 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  50.7 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  46.94 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  47.33 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  46.9 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  41.67 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  42.25 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  45.64 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  39.33 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  42.45 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  44.6 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  43.88 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.01 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  42.45 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  40.56 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  42.95 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  39.46 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  41.06 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  40.56 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  39.46 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  39.29 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  40.27 
 
 		 295 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  35.42 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  40.82 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  42.86 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  41.5 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  39.73 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.73 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.48 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.66 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.07 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  34.84 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.84 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.8 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.79 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  32.39 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.48 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.56 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40.14 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.56 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.56 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  36.13 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.79 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.17 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.25 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.31 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.16 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30.5 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.41 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  38.46 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  31.69 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  35.97 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.69 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.18 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.48 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  32.3 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  32.39 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.33 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.29 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.29 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.09 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.39 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.12 
 
 		 515 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.64 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.24 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.43 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  31.29 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.97 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>