161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2057 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  42.75 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  40.71 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  37.96 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  36.84 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40.71 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  37.59 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  38.52 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.97 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  33.81 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.17 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  34.78 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  33.57 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  35.07 
 
 		 295 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  32.85 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  34.51 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  32.86 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.04 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  34.31 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  34.29 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  37.96 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.43 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  31.16 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.09 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.94 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  35.97 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  33.54 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  30.43 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.57 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  29.93 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.33 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  29.2 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  27.03 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  32.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1687  UspA domain protein  32.85 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.5 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.66 
 
 		 325 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  24.84 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.5 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1626  UspA domain protein  30.97 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.5 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.78 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  45.28 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.43 
 
 		 304 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.08 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.06 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  45.28 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.04 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  27.34 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.35 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  29.58 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  32.39 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.08 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  26.06 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  44 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  43.14 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  45.28 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  50 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  23.08 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4822  hypothetical protein  25.49 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  45.28 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.24 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.74 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.28 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.76 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.85 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.47 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1029  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 		 293 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.39 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.87 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.87 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.09 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.46 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  28.37 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.66 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1965  UspA domain protein  29.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26.76 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  29.71 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.32 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.52 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  30.58 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.86 
 
 		 207 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3734  UspA domain protein  32.14 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  26.43 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.2 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.78 
 
 		 294 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  41.51 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  25.93 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.56 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>