More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1509 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.26 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  41.29 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.54 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
145 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.14 
 
 
180 aa  80.1  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.16 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  36 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.85 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.11 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  35.42 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  36.17 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.81 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.79 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.09 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.25 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.82 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.46 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.85 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.89 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.53 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.11 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.58 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.25 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  37.09 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.51 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.86 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.92 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  29.94 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.25 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  29.94 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.17 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  30.22 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.33 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  30.43 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.34 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.73 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  25.48 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.39 
 
 
290 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34.01 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  35.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.87 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.94 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  31.08 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
274 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.14 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  32.45 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.14 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.97 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.27 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.93 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  32.17 
 
 
283 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.7 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.89 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.4 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.72 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  29.58 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  27.34 
 
 
207 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.34 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.01 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  34.23 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  32.41 
 
 
289 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.33 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  29.93 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.56 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>