More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3427 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  100 
 
 
156 aa  298  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  87.5 
 
 
153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  65.49 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  59.33 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  65.97 
 
 
154 aa  151  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  48.23 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.45 
 
 
152 aa  111  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  45.83 
 
 
158 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  44.14 
 
 
152 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.79 
 
 
159 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  39.57 
 
 
149 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  44.37 
 
 
288 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  45.27 
 
 
156 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  43.05 
 
 
153 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  43.36 
 
 
307 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.88 
 
 
150 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  44.76 
 
 
290 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  38.3 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  40.29 
 
 
207 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  41.96 
 
 
208 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.5 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  42.07 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  42.86 
 
 
305 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  40.43 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  39.46 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.46 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  43.57 
 
 
280 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.57 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  40.97 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.51 
 
 
156 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.97 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.43 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.55 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  42.86 
 
 
297 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  42.67 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  87  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.8 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.43 
 
 
300 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
141 aa  85.5  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  38.04 
 
 
301 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  36.42 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  38.57 
 
 
159 aa  84  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  40.88 
 
 
283 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  37.76 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.01 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.5 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  41.61 
 
 
415 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  38.82 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.67 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  43.8 
 
 
281 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.42 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  35.66 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  38.13 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  41.26 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.42 
 
 
283 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.33 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  37.41 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  35.66 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  37.14 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  40.14 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  40.14 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40 
 
 
287 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.33 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.36 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  77  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  41.13 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  35 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.69 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  38.46 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  38.3 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.86 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>