More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1980 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  100 
 
 		 150 aa  293  8e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  43.79 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  43.79 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  44.52 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  45.16 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  46.45 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  40.65 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  42.48 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  39.22 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  38.99 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  38.75 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  39.87 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  37.82 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  41.89 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  39.6 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  42.21 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  38.56 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  38.61 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  33.13 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  38.26 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  36.08 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  35.53 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  38.56 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  38.06 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  35.33 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  32.68 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  36.05 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  34.84 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  33.96 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  36.67 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  33.99 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.31 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.48 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.48 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.95 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.58 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.08 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  29.8 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  33.54 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.92 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.18 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.94 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  36.75 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  41.23 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.45 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.52 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.03 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.97 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.81 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  33.96 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.05 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.22 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.87 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  28.57 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.67 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.77 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.52 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  34.97 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  34.97 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  30.19 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  34.81 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.78 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.3 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.25 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  28.95 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.15 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  37.25 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  31.85 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.13 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  33.77 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  31.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.52 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.9 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  34.87 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  35.53 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.77 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.88 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  32.47 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.68 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  28.66 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  33.55 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>