More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0354 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  82.76 
 
 		 145 aa  253  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  79.31 
 
 		 145 aa  245  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  79.31 
 
 		 145 aa  242  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  36.3 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  35.92 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.81 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  36.3 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  36.55 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  35.42 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.8 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 297 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  32.41 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  32.41 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  32.41 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  32.41 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  32.41 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.44 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  33.8 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  35.21 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  33.8 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  33.1 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.5 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.68 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.89 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  32.12 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.97 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.03 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  31.69 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  34.72 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.03 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  32.17 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.11 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  32.89 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.03 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.28 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.72 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  30.56 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  32 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.03 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.68 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.14 
 
 		 300 aa  63.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  27.86 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26.21 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.99 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.47 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  27.81 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.13 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.92 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.17 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.41 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.08 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  32.43 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  33.56 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.4 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.21 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.39 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.41 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>