More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00791 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  92.41 
 
 		 145 aa  277  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  82.07 
 
 		 145 aa  256  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  79.31 
 
 		 145 aa  245  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  38.36 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  33.8 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.33 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  30.28 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  35.42 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  35.17 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  34.48 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  34.48 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  34.48 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  34.48 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  34.48 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  34.48 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.29 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 297 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.56 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  33.1 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  31.91 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  34.51 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  34.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  34.23 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.46 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  35.66 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.01 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.25 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.69 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  32.41 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  32.41 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  32.41 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  28.87 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  29.53 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  32.41 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  32.41 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.67 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  32.41 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.82 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  31.72 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.89 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.21 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.66 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.29 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  32.03 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.99 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  27.52 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.68 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.25 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.41 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.77 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  28.47 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.33 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32.43 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 324 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.2 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.29 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.28 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  31.03 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  23.81 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.9 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.67 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  30.34 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.89 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.87 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  30.37 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  30 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.77 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  26.85 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  31.91 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  30.34 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>