More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001681 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  92.41 
 
 		 145 aa  277  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  83.45 
 
 		 145 aa  256  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  79.31 
 
 		 145 aa  242  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  39.73 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  33.1 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  33.8 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  36.81 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  36.55 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.76 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  36.3 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  36.3 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  36.3 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  36.3 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  36.3 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  29.58 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  33.8 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  35.21 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.9 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  34.25 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34.27 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.57 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 297 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.65 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.88 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.27 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.12 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28.29 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.69 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.86 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.76 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.14 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.53 
 
 		 307 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  31.03 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.86 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  32.68 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.56 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.73 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.94 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.82 
 
 		 304 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.37 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  34.27 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.47 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.61 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  31.72 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.07 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.57 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  28.86 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.77 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  29.05 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  26.85 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  31.39 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  30.46 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.63 
 
 		 300 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  33.77 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.87 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.21 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  28.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28.57 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.58 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.66 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  30.34 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  31.76 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  22.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  25.52 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  30.5 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.67 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>