269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2566 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  289  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
143 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  47.55 
 
 
142 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  47.55 
 
 
142 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  47.55 
 
 
142 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  47.55 
 
 
142 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  47.55 
 
 
142 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  47.55 
 
 
142 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  47.55 
 
 
142 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  46.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  47.55 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 
142 aa  133  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  41.96 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  41.96 
 
 
142 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  41.26 
 
 
143 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
142 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  41.26 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  39.31 
 
 
144 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  39.31 
 
 
144 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  39.31 
 
 
144 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  39.31 
 
 
144 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  39.31 
 
 
144 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  38.62 
 
 
144 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  38.62 
 
 
144 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
144 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  38.62 
 
 
144 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  38.62 
 
 
144 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  38.62 
 
 
144 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  38.62 
 
 
144 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  38.62 
 
 
144 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  37.93 
 
 
144 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  33.57 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  42.39 
 
 
97 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  42.39 
 
 
97 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  42.39 
 
 
97 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  42.39 
 
 
97 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  42.39 
 
 
97 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  32.17 
 
 
143 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  33.57 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  31.47 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  34.03 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  32.87 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  31.94 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  36.05 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  32.19 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  36.55 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  30.14 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  31.47 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  33.56 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  33.11 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  30.67 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.23 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  29.66 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.97 
 
 
294 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  27.73 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  50.91 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.47 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.36 
 
 
296 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.54 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.27 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.27 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  29.58 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.51 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  28.19 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.33 
 
 
151 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  26.21 
 
 
135 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.61 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  28.95 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  25.69 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.97 
 
 
301 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  27.33 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.77 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.41 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  28.28 
 
 
217 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  26.81 
 
 
303 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.77 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.67 
 
 
304 aa  50.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  26.03 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.08 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  27.95 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  28.28 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.38 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.21 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  27.12 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.72 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.59 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  28.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  25.52 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>