More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1584 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  100 
 
 
295 aa  592  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 
314 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
449 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.79 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  31.89 
 
 
306 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  30.52 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  32.33 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 
297 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  29.67 
 
 
287 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 
291 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  29.53 
 
 
287 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 
317 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
317 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
297 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  31.05 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  28.53 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.06 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.97 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.67 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.97 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  29.91 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.37 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  26.69 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.84 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  32.82 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.35 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  26.2 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.78 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.07 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  28.29 
 
 
151 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.34 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  29.14 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  27.52 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.39 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.79 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.29 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  25 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.75 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  28.29 
 
 
156 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.28 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  32.43 
 
 
152 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  30.92 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.4 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.35 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.56 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  26.67 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  29.93 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34.25 
 
 
154 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
155 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  26.67 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  29.45 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  26.67 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  26.67 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  26.67 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  26.67 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  23.87 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  30.87 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.98 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  26.71 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  31.03 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  26.71 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  30.87 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  30.87 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  27.03 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  27.03 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  25.83 
 
 
151 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  29.25 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  31.76 
 
 
144 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.62 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  28.86 
 
 
155 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.16 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  32 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.84 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.26 
 
 
156 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  26.17 
 
 
151 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  30.87 
 
 
152 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.61 
 
 
153 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  30.87 
 
 
152 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  23.61 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  30.87 
 
 
152 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
144 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  28.48 
 
 
156 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>