More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1937 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  289  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  55.94 
 
 
142 aa  166  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  55.24 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  55.24 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  55.24 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  54.55 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  54.55 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  54.55 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  54.55 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  54.55 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  54.55 
 
 
142 aa  160  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
143 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  39.16 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  39.16 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  39.86 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  39.16 
 
 
142 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  49.47 
 
 
97 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  49.47 
 
 
97 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  49.47 
 
 
97 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  49.47 
 
 
97 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  49.47 
 
 
97 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  39.16 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  37.06 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  29.66 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  29.66 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  29.66 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  29.66 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  29.66 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  35.66 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  34.97 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  28.97 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  28.28 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  28.28 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  28.28 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  28.28 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  28.28 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  28.28 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  28.28 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  32.87 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  31.47 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.56 
 
 
307 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  31.47 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  30.07 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  29.8 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.56 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.69 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.17 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.14 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.29 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.67 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  31.54 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.67 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.25 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  32.24 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.99 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  26.9 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  26.39 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  35.62 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.97 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.43 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  29.33 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  30.2 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  28.77 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.82 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.37 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.56 
 
 
276 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.05 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.58 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  32.45 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  27.08 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.89 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  30.46 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.46 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  31.25 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.33 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.11 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  30.32 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.32 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
294 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.14 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>