More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1834 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  286  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  71.13 
 
 		 142 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  71.13 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  70.42 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  69.72 
 
 		 142 aa  203  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  43.75 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  43.75 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  43.75 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  43.75 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  43.75 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  43.06 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  45.21 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  45.21 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  45.21 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  45.21 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  45.21 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  43.06 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  45.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  45.21 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  35.92 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  37.32 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  35.92 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  35.17 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  36.11 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  36.11 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  34.97 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  33.78 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  31.69 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  36.3 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  35.66 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  34.97 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  33.11 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  31.08 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  34.72 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.51 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.44 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.25 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  31.97 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  30.56 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  49.23 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  37.5 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.25 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  29.25 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  28.3 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.54 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.34 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.53 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.58 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.58 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.61 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  26 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  25.62 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  28.87 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.88 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  30.28 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.38 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.41 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.23 
 
 		 303 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  28.38 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  26.14 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  26.14 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.7 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.49 
 
 		 289 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.21 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>