More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2210 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  100 
 
 
149 aa  296  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  50.64 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.9 
 
 
290 aa  80.9  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  39.16 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.1 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.67 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.01 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.93 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.37 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.89 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.21 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.94 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.97 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  36.84 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  33.57 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.72 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.54 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  31.29 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.33 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.8 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.56 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  31.29 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  31.29 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.61 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.14 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.1 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.13 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.68 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.54 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.21 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.68 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.7 
 
 
208 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.21 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  34.01 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  31.79 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.81 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  31.79 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.97 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.41 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.87 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.93 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  27.22 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.55 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  27.63 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.13 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0206  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.03 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.89 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  29.53 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.48 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  32.69 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.85 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  31.29 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.54 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  34.03 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.86 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.82 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.72 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  27.78 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.61 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.3 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.85 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  32.21 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.67 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
300 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.19 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.8 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.41 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>