More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1777 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  99.31 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  99.31 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  99.31 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  99.31 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  99.31 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  99.31 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  63.89 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  44.9 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  42.18 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  42.76 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  43.45 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  39.73 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  39.04 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  39.04 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  39.04 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  39.04 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  39.04 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  39.04 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  38.36 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  37.84 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  37.16 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  36.3 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  36.99 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  37.67 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  36.3 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  36 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  35.37 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  39.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  32.88 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  34.69 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  34.25 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  31.94 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  37.16 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  34.25 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  32.65 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.62 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  34.23 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.28 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  31.29 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.47 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.77 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.79 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  34.27 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  34.01 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  32.39 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.67 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.38 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  36.18 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.87 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  29.73 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  28.29 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  29.17 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.37 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  23.49 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  31.03 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  35.09 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  35.09 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.37 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.66 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.69 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.17 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.17 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  28.28 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  25.74 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.97 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  25 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  25 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  25 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  30.87 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  49.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>