259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1352 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  44.44 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  38.52 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  38.24 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  38.69 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  37.5 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  32.89 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  32.62 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  36.43 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6187  UspA domain protein  34.17 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  0.351957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.81 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  39.13 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  34.04 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  34.27 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  40 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  40 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  40 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  40 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  40 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  42.17 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  32.47 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  32.62 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  34.03 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.82 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  32.47 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  51.79 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  32.63 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  51.79 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.65 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.25 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  32.17 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  43.33 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  32.87 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  28.76 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  39.09 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  33.81 
 
 
155 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  49.09 
 
 
144 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  39.29 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.09 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  30.77 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  38.98 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.31 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.72 
 
 
307 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.36 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  40.68 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  50 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  32.62 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  27.97 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  43.33 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.62 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.8 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  39.68 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.05 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  44.64 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  30.07 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  44.64 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  43.33 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  42.11 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.86 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  27.97 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  44.07 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.5 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.04 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  30.99 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.37 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.68 
 
 
150 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  32.29 
 
 
144 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>