More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1935 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  55.07 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  42.55 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  41.83 
 
 		 303 aa  90.9  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  43.57 
 
 		 183 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.89 
 
 		 288 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  40.29 
 
 		 339 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  39.13 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.14 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  39.19 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.73 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  39.16 
 
 		 288 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  40.43 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  40.15 
 
 		 324 aa  77.8  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.89 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.74 
 
 		 292 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 292 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  39.46 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  38.57 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  37.04 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  39.31 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  37.41 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.59 
 
 		 310 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.46 
 
 		 284 aa  74.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.76 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  37.32 
 
 		 305 aa  73.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  38.81 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  37.58 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  40.6 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  39.16 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  39.85 
 
 		 341 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  39.85 
 
 		 341 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.23 
 
 		 294 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  38.36 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.62 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  37.5 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  36.11 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.81 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  38.3 
 
 		 293 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 293 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 293 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  42.22 
 
 		 275 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.42 
 
 		 373 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 290 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 276 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.67 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  33.82 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.67 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.67 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  37.59 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  35.66 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  34.31 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.55 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.57 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  35.66 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  36.91 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30.15 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  43.66 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  49.23 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.21 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  36.96 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>